Он признан виновным в совершении преступления предусмотренного ч.4 ст.159 «Мошенничество, совершенное организованной группой либо в особо крупном размере» УК РФ. В 2006 году Институт нефтехимии и катализа РАН, возглавляемый Джемилёвым, приобрёл для нуждающихся в жилье молодых учёных двухкомнатную квартиру. Однако квартира была передана его зятю и коллеге Дьяконову, который в улучшении жилищных условий не нуждался. Далее служебная квартира была приватизирована, а в 2012 году продана третьим лицам.